Kostenlose, öffentlich zugängliche Gesundheits-Daten erweist sich als Forschungs-gold-mine: die Entdeckung könnte helfen, festzustellen, welche Krebs-Patienten profitieren von Immuntherapie

Es ist eine beliebte Frage: Was hast du über den Sommer? Für Lubaba (Aurna) Khan, Sommer 2018 wird man Sie nie vergessen wird.

Es begann auf einem hohen Ton und endete auf einer noch höheren. Im Juni, Khan ging über die Bühne zu akzeptieren, Ihr Studium als eine Universität von Calgary-Bachelor of Health Science Absolventen. Sie erhalten eine O ‚ Brien-Zentrum Sommer-Stipendien-award, der Landung nach einem Forschungs-Auftrag mit Dr. Pinaki Bose, PhD. Dann, unerwartet, machte Sie eine Entdeckung, die helfen könnte, Krebs-Patienten in der ganzen Welt.

Khan verbrachte die Sommer gebeugt über einen computer, Dolmetschen, Kostenlose, öffentlich zugängliche Gesundheits-und Genomik-Daten. „Bioinformatik ist die neue Grenze der Medizin“, sagt Khan. „Ich begann meine medizinische Ausbildung als biomedizinische Schüler, suchen in Zellen durch ein Mikroskop, aber mit Blick auf die Krebs-Biologie, die mit Hilfe eines Computers öffnet sich ein neues denken über die Forschung“aus.

Khan war der Vergleich der Unterschiede zwischen den Genen gefunden, die in Tumorzellen und in normalen Zellen. Arbeiten unter der Anleitung von Bose, Khan gelernt, wie zu konstruieren, Fragen und Hypothesen. Es war einen Holprigen start.

„Wir wollten herausfinden, wie immun-Gene in Krebszellen, die möglicherweise im Zusammenhang mit einer Immuntherapie Antwort. Es war nichts da, und wir waren enttäuscht“, sagt Bose, der ist ein adjunct assistant professor in den Abteilungen von Biochemie und Molekularbiologie und Onkologie, und ist ein Mitglied der Arnie Anthony Hibbert Cancer Institute an der Cumming School of Medicine.

„Wir richteten unseren Fokus, und entdeckt, dass ein anderer Satz von Genen, die im Zusammenhang mit der extrazellulären matrix, hatte eine direkte Verbindung, wie Krebs-Patienten sprechen auf die Immuntherapie.“

Die Immuntherapie hat sich zu einem beliebten Behandlung für einige Krebsarten. Es nutzt der Körper das eigene Immunsystem angreifen und töten Krebszellen. Die Behandlung ist effektiv, aber nur für einige wenige, etwa 20 bis 30 Prozent der Patienten. Es gibt kein klares Verständnis, warum manche Menschen eine bessere Reaktion auf die Immuntherapie als andere.

Die extrazelluläre matrix kann halten einige der Antworten; es wächst in und um sowohl gesunde als auch Krebszellen.

„Wir haben festgestellt, dass Gene, die mit der extrazellulären matrix sind übermäßig produziert bei Patienten, die reagieren nicht auf die Immuntherapie“, sagt Bose, der auch der Direktor der translationalen Forschung für die Ohlson-Forschungs-Initiative. „Diese Gene sind, produziert von Zellen der Umgebung des Tumors, und Sie bilden eine Barriere, die hilft, Krebszellen entziehen sich der Erkennung durch das Immunsystem.“

Die UCalgary team gemeinsam die Entdeckung, Forscher an der Universität von Toronto, die validiert wurden die Ergebnisse jetzt veröffentlicht in Nature Communications. „Ich war wie, wow, ich bin ein student. Ich wusste nicht, wie wichtig dies war, bis Dr. von Bose wies darauf hin, wie bedeutsam diese Entdeckung könnte in der Behandlung von Krebs. Es Art von warf mich ab, aber ich war extrem aufgeregt zugleich“, sagt Khan, wer ist der co-erste Autor auf der Studie.

Die Forscher untersuchten mehr tief zu Ihren Ergebnissen und entdeckten ein gen-Signatur, die dazu führen könnten, die die Entwicklung eines einfachen Tests, die helfen könnten bestimmen, welche Patienten profitieren von der Hyposensibilisierung. Der nächste Schritt wird sein, zu beweisen, die Ergebnisse in einem Labor.

„Die Analyse von big data nicht ersetzen bench Wissenschaft, aber es ein großes Werkzeug für die Hypothese-Gebäude und führen zu neuen Einsichten“, sagt Bose.

Für Khan, hat diese Erfahrung änderte den Lauf Ihres zukünftigen Studien. Sie ist immer geplant, zu verfolgen einen master-Abschluss in der öffentlichen Gesundheit, und jetzt sieht die Zukunft konzentriert sich auf die Analyse der Daten, anstatt Daten-Sammlung.

Pinaki Bose Forschung wird unterstützt von Ohlson Research Initiative und die Anthony Hibbert Cancer Institute.